大孤山镇境内自然资源比较丰富。全镇地处松辽平原中南部农业区，土质肥沃，土地资源丰富，有耕地8880公顷，是国家首批确定的大型商品粮示范基地，境内有孤山河、新开河等大小河流4条，总水域面积730公顷，有欢欣岭水库1座，总库容量可达1800万立方米。全镇有林地面积4063公顷，荒山荒坡4840公顷，荒滩荒沟440公顷，水库、塘坝307公顷，镇内野生植物41科，300多种，其中药用植物上百种，工业原料类36种，全镇已探明矿藏有煤、大理石、天然气、麦饭石、玄武岩、硅灰石、石灰石、纯净矿泉水等。其中麦饭石，天然气储量丰富。