Il tire son nom de saint Goustan, le patron des marins et des pêcheurs.

Au début du XVIIe siècle, la communauté de ville d'Auray décide de construire un port sur la rive gauche du Loc'h. Des quais et des cales sont aménagés afin de faciliter le déchargement des bateaux de commerce. Jusqu'alors, les vaisseaux utilisaient des équipements réduits ou se laissaient échouer sur les bords de la rivière.
Le « rôle » des taxes portuaires de 1537 témoigne de l'activité commerciale de Saint-Goustan. La ville importe du vin, du sel, du cuir, du fer et de l'acier de Biscaye. En retour, elle exporte du froment, du seigle, de l'avoine, du beurre, de la viande, du poisson, du drap et de la toile. Le Pays d'Auray est, à l'époque, un producteur excédentaire de céréales.
L'aménagement du grand port d'Auray s'achève en 1641 par la construction d'un quai et de deux cales reliant le vieux quai et celui construit en 1615.
Ces travaux donnent naissance à la place Saint-Sauveur puis se poursuivent vers le sud par la construction de l'actuel quai Franklin. Des « bouches de pierre » ou bittes d'amarrage sont plantées en 1692 pour attacher les amarres des navires.
La création du port de Lorient (1665-1670) et le manque d'importantes voies routières pour relier Saint-Goustan à l'arrière-pays sont à l'origine de la baisse d'activité du port. Elle s'accroît par l'arrivée du chemin de fer et la création en 1865 d'une nouvelle voie d'accès à Auray qui isole le port et réduit encore ses échanges commerciaux. Au XIXe siècle, le développement du port de Lorient, l'avènement du charbon et le développement du réseau ferré prive le port d'une partie de ses activités de cabotage. Seul le transport de poteaux de bois pour étayer les mines de charbon du pays de Galles assure encore au début du XXe un peu d'activité sur le quai Franklin.
Le port est peint par de nombreux artistes, dont Odilon Redon et Mathurin Méheut.
Le port devenu port de plaisance d'environ 155 places est adossé au quai. Il a été classé port départemental et accueille plus de 1300 bateaux visiteurs par an (en 2007)

Le nom de ce quai est un hommage à Benjamin Franklin, célèbre diplomate, physicien et ingénieur qui a débarqué à Auray le 4 décembre 1776 pour appeler les Français à soutenir les Américains dans leur guerre d'indépendance. Des vents contraires avaient empêché son navire de remonter jusqu'à Nantes.
Cependant le port, sous sa forme ancienne date au moins du XIIe siècle. Pour permettre ou faciliter le chargement et déchargement des gros navires capables de remonter la rivière d'Auray (ou rivière du Loc'h), l'administration décida, au début du XVIIe siècle, d'y construire un quai de pierre pour remplacer les pontons de bois qui tenaient lieu de port en fond de ria. Ce qui sera construit sur celle des berges qui était la plus accessible, la rive gauche.
Les travaux ont commencé en 1614 et seront prolongés en 1630.
Vers 1680, le quai situé devant la place Saint-Sauveur est prolongé (jusque devant l'actuelle maison n° 12). Il est à nouveau prolongé de 13 m en 1742.
L'ancien port d'Auray fut achevé en 1641 (prolongement du quai et construction de deux rampes en grosses pierres de granit ocre pour l'épais mur de soutènement).
Le quai a ensuite été réparé en 1742. En 1791, il nécessite de nouvelles réparations qui se feront de juin 1846 à fin 1852. C'est de cette époque que date le pavage du quai.
Au cours du XXe siècle, alors que le port de Saint-Goustan devenait l'un des sites touristiques les plus fréquentés du Pays d'Auray pour son caractère pittoresque et les maisons à colombages de la « place Saint-Sauveur » et du Morbihan, les grosses pierres de granit de ce quai se sont peu à peu désolidarisées, et la circulation de l'eau a creusé des poches derrière le mur de soutènement. Le quai se dégrade à nouveau ; en 1902 il a glissé de plus de 50 cm vers le fleuve. La mairie ne peut envisager de financer les réparations proposées par les ingénieurs des Ponts et chaussées qui proposent de reconstruire entièrement près de 68 m de quai. En 1935, le maire alerte sur le fait que le quai continue à menacer ; l'année suivante, en 1936, il s'effondre sur environ 30 m. Il faudra attendre 3 ans pour que les réparations soient entamées, mais les travaux sont faits dans l'année en 1939.
Le quai mesure 220 mètres et est classé en ZPPAUP ainsi qu'au titre de la protection du Monument naturel du Golfe du Morbihan. Le quai est jouxté par des restaurants et hôtels, et accueille des braderies, expositions d'artistes, ventes de cartes postales, un manège et diverses activités (saisonnières), ainsi que des activités de formations au nautisme. Un bateau promenade pour les îles y a un appontement. Un gréement traditionnel visitable y était accosté à demeure. Ce bateau contenait un petit musée qui présentait notamment une réplique du port de Saint-Goustan.
Fin 2008 une partie du quai s'étant affaissé et menaçant de s'écrouler, et ce quai étant important pour la stabilité des maisons riveraines, il a fallu le consolider en urgence par un remblai de grosses pierres. Cette partie du quai nécessite d'importantes réparations (1,88 million d'euros, avec une première phase de 5 mois qui devrait être entreprise en janvier 2009).
En décembre 2008, une association a été créée avec la fondation du patrimoine, pour favoriser la souscription volontaire de bons de soutien afin de restaurer le quai2.
Dans cette opération, la « goëlette » Saint-Sauveur fut cassée en deux3.

Animations
Édicule de granit sculpté, Port de Saint-Goustan, face au quai Benjamin Franklin
Le port Saint-Goustan accueille chaque année de nombreuses manifestations :
Marchés du livre et de la carte postale
Marchés de l'artisanat
Joutes du Loc'h
Festival du l'huître de Bretagne Sud

Environnement
De par sa situation quasi-estuarienne et grâce à la présence de quelques vasières, le port et la vallée accueillent diverses espèces d'oiseaux marins. Les quais sont couverts de varech et localement d'huîtres.
La rivière d'Auray, qui est en fait un petit fleuve côtier, joue un rôle important de corridor biologique, pour les poissons mais aussi pour les oiseaux. À ce titre, elle est un des éléments naturels de la trame verte nationale promue par le Grenelle de l'Environnement.
http://fr.wikipedia.org/wiki/Port_Saint-Goustan