座落於台南市左鎮區菜寮溪流域的「台南市菜寮化石館」，是在1981年興建啟用，館藏保存並展示著菜寮溪挖掘出土的化石，也有部分收藏購自國外，館區並規劃有不定期的主題特展，提供民眾考古研究、古地質生態教育的學習平台。由於菜寮溪流域的地形地質條件特殊，當颱風豪雨過後，沖刷後的河床上散落著各種古生物化石：有古象、古鹿、犀牛之陸相遺骸，也有大量貝殼、魚類之海相化石。此區不僅是台灣最早發現脊椎動物化石的地方，當地發現的人類化石，依地緣關係被稱為「左鎮人」，開啟了台灣研究史前人類重要的篇章。