五分港溪早先屬於雙溪川的下游，向下流入基隆河，也同時與基隆河分割出一片沙洲沃土，稱為洲尾（今「洲美」），有著臺北市裡難得見到的廣大稻田。又由於頂洲尾、洲尾頭一帶的雙溪川河道蜿蜒，水患頻仍，因此在1965年進行了截彎取直工程，讓雙溪川從現在的雙溪濕地公園一帶進入基隆河，雙溪川的舊河道就成了「五分港溪」，並且在五分港溪前後設有閘門防洪，因而消除淹水的風險，於是此地一度被人們「遺忘」，遂能維持生態地景，為日後重獲新生打下基礎。可以說在截彎取直工程的無心插柳，保存了河道自然的風貌，形成了臺北市內的秘境。